公司博客
Home / 基因组 / 已发表或在进行中的动物基因组——鱼

已发表或在进行中的动物基因组——鱼

0

鱼类属于脊索动物门中的脊椎动物亚门。其特征是有鳃的水生动物,缺乏四肢及肢末端的指。鱼类占到了脊索动物的一半多(53%)。鱼类包括盲鳗、七鳃鳗、软骨鱼及硬骨鱼等,也包括许多已经绝种的物种。鱼属于冷血动物,其体温会随外在环境温度而变化,不过像大白鲨及鲔鱼可以将体温维持在较高的温度。在大部份的水体中都有鱼。几乎所有的水生环境中都有鱼,从高山的溪流到深海带甚至超深海渊带。鱼比其他的脊椎动物有更多的物种变异性。通过下图我们可以发现鱼类可以分为两个总纲:无颔总纲和有颔总纲。其中无颔总纲有可分为盲鳗纲和七鳃鳗纲;有颔总纲又可分为:软骨鱼纲、辐鳍鱼纲和肉鳍鱼纲。

七鳃鳗纲

物种 分类 刊物 发表时间 测序平台 基因组大小 链接
七鳃鳗 七鳃鳗目七鳃鳗科 Nat. Genet. 2013.2 Illumina 0.816Gb 文章链接

软骨鱼纲

物种 分类 刊物 发表时间 测序平台 基因组大小 链接
姥鲨 鲭鲛目姥鲨科 Nature 2014.1 454/Sanger 937Mb 文章链接

辐鳍鱼纲

物种 分类 刊物 发表时间 测序平台 基因组大小 链接
红鳍东方鲀 鲀形目四齿鲀科 Science 2002.8 Sanger 365Mb 文章链接
金娃娃 鲀形目四齿鲀科 Nature 2004.10 Sanger 342Mb 文章链接
金娃娃 鲀形目四齿鲀科 Nature 2004.10 Sanger 342Mb 文章链接
菊黄东方鲀 鲀形目四齿鲀科 DNA Res. 2014.7 Solid 390Mb 文章链接
青鳉 颌针鱼目异鳉科 Nature 2007.6 Sanger 700Mb 文章链接
花斑剑尾鱼 鳉形目花鳉科 Nat. Genent. 2013.3 454/Illumina/Sanger 750-950Mb 文章链接
大西洋鳕鱼 鳕形目鳕科 Nature 2011.8 454 830Mb 文章链接
三刺鱼 刺鱼目刺鱼科 Nature 2012.4 Sanger 530Mb 文章链接
斑马鱼 鲤形目鲤科 Nature 2013.4 Sanger 1.41Gb 文章链接
太平洋蓝旗金枪鱼 鲈形目鲭科 Proc. Natl. Acad. Sci. 2013.6 454/Illumina 800Mb 文章链接
半滑舌鳎 鲽形目舌鳎科 Nat. Genet. 2014.2 Illumina 545Mb 文章链接
虹鳟鱼 鲑形目鲑科 Nat. Commun. 2014.4 Sanger/454 1.9Gb 文章链接

肉鳍鱼纲

物种 分类 刊物 发表时间 测序平台 基因组大小 链接
矛尾鱼 腔棘目矛尾鱼科 Nature 2013.4 Illumina 2.86Gb 文章链接
矛尾鱼 腔棘目矛尾鱼科 Genome Res. 2013.7 Illumina 2.74Gb 文章链接

进行中的基因组

物种 分类 测序平台 基因组大小 链接
石斑鱼 鲈形目鮨科 Illumina 1.1Gb 相关链接
大黄鱼 鲈形目石首鱼科 Illumina 750Mb 相关链接
联系我们