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已发表或在进行中的动物基因组——哺乳动物

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哺乳动物是脊椎动物亚门下一类用肺呼吸空气的温血脊椎动物,因能通过乳腺分泌乳汁来给幼体哺乳而得名。哺乳纲的动物主要分为原兽亚纲和兽亚纲,而兽亚纲又可分为真兽下纲和后兽下纲。目前大部分已测的哺乳动物为真兽下纲,而最为人们所熟知的原兽亚纲为鸭嘴兽,最为人们所熟知的后兽下纲为袋鼠及已测序的负鼠。下图是目前哺乳动物纲的分类情况,左边是基于形态得到的结果,而右边是基于遗传物质。虽然我们永远也不可能得到最真实的结果,但随着不同证据的累计,我们将离真实结果越来越近

原兽亚纲

物种 分类 刊物 发表时间 测序平台 基因组大小 链接
鸭嘴兽 单孔目鸭嘴兽科 Nature 2008.5 Sanger 1.84Gb 文章链接

后兽下纲

物种 分类 刊物 发表时间 测序平台 基因组大小 链接
短尾负鼠 负鼠目负鼠科 Nature 2007.5 Sanger 3.4Gb 文章链接
袋獾 袋鼬目袋鼬科 Proc. Natl. Acad. Sci. 2011.5 454/Illumina 3.3Gb 文章链接
尤金袋鼠 双门齿目袋鼠科 Genome Biol. 2011.12 Solid/454/Illumina 2.9Gb 文章链接

真兽下纲(一)

物种 分类 刊物 发表时间 测序平台 基因组大小 链接
树鼩目
树鼩 树鼩目树鼩科 Nat. Commun. 2013.2 Illumina 3.2Gb 文章链接
翼手目
果蝠
大卫鼠耳蝠
翼手目狐蝠科
翼手目蝙蝠科
Science 2012.11 Illumina 2Gb 文章链接
布氏鼠耳蝠 翼手目蝙蝠科 Nat. Commun. 2013.8 Illumina 2Gb 文章链接
灵长目
灵长目人科 Nature 2001.2 Sanger 3Gb 文章链接
黑猩猩 灵长目人科 Nature 2005.9 Sanger 2.7Gb 文章链接
红毛猩猩 灵长目人科 Nature 2011.1 Illumina 3.09Gb 文章链接
大猩猩 灵长目人科 Nature 2012.3 Sanger/Illumina 3.04Gb 文章链接
倭黑猩猩 灵长目人科 Nature 2012.6 454 2.7Gb 文章链接
恒河猴 灵长目猴科 Science 2007.4 Sanger 2.87Gb 文章链接
食蟹猴中国恒河猴 灵长目猴科 Nat. Biotechnol. 2011.11 Illumina 2.85Gb 文章链接
马来西亚食蟹猴 灵长目猴科 Genome Biol. 2011.11 Illumina 3Gb 文章链接
指猴 灵长目指猴科 Genome Biol. Evol. 2012.8 Illumina 2.87Gb 文章链接
普通绒猴 灵长目卷尾猴科 Nat. Genet. 2014.7 Sanger 2.26Gb 文章链接
普通绒猴 灵长目卷尾猴科 Nat. Genet. 2014.7 Sanger 2.26Gb 文章链接
食肉目
食肉目犬科 Nature 2005.11 Sanger 2.41Gb 文章链接
食肉目猫科 Genome Res. 2007.11 Sanger 2.7Gb 文章链接
东北虎 食肉目猫科 Nat. Commun. 2013.9 Illumina ~2.4Gb 文章链接
大熊猫 食肉目熊猫科 Nature 2010.1 Illumina 2.25Gb 文章链接
北极熊棕熊 食肉目熊科 Proc. Natl. Acad. Sci. 2012.7 Illumina 2.25Gb 文章链接

真兽下纲(二)

物种 分类 刊物 发表时间 测序平台 基因组大小 链接
鲸目
白鱀豚 鲸目白鱀豚科 Nat. commun. 2013.10 Illumina 2.8Gb 文章链接
小须鲸 鲸目须鲸科 Nat. genet. 2013.11 Illumina 2.44Gb 文章链接
长鼻目
古猛犸象 长鼻目象科 Nature 2008.11 454 4.7Gb 文章链接
奇蹄目
奇蹄目马科 Science 2009.11 Soild 2.7Gb 文章链接
普氏野马驴 奇蹄目马科 Nature 2013.6 Illumina 2.7Gb 文章链接
偶蹄目
杜洛克猪 偶蹄目猪科 Nature 2012.11 Sanger/Illumina 2.6Gb 文章链接
五指山猪 偶蹄目猪科 GigaScience 2012.11 Illumina 2.6Gb 文章链接
双峰骆驼 偶蹄目骆驼科 Nat. commun. 2013.8 Illumina 2.38Gb 文章链接
偶蹄目牛科 Science 2009.4 Sanger 2.87Gb 文章链接
牦牛 偶蹄目牛科 Nat. Genet. 2012.7 Illumina 2.87Gb 文章链接
山羊 偶蹄目牛科 Nat. Biotechnol. 2012.11 Illumina 2.66Gb 文章链接
藏羚羊 偶蹄目牛科 Nat. Commun. 2013.5 Illumina 2.75Gb 文章链接
绵羊 偶蹄目牛科 Science 2014.6 Illumina 2.75Gb 文章链接
兔形目
兔子 兔形目兔科 Science 2014.8 Sanger 2.66Gb 文章链接
啮齿目
小鼠 啮齿目鼠科 Nature 2002.10 Sanger 2.5Gb 文章链接
大鼠 啮齿目鼠科 Nature 2004.2 Sanger 2.75Gb 文章链接
裸鼹鼠 啮齿目滨鼠科 Nature 2011.10 Illumina 2.66Gb 文章链接
达马拉兰鼹鼠 啮齿目滨鼠科 Cell Reports 2014.8 Illumina 2.5Gb 文章链接
仓鼠 啮齿目仓鼠科 Nat. Biotechnol. 2013.7 Illumina 2.4Gb 文章链接
盲鼹鼠 啮齿目鼹形鼠科 Nat. Commun. 2014.6 Illumina 3.0Gb 文章链接
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